Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRMS1Q9HCU9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms