Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC24A3Q9HC58 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC24A3Q9HC58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms