Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCSQ9HAB8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCSQ9HAB8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms