Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms