Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP13A3Q9H7F0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP13A3Q9H7F0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms