Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF3Q9H4W6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.3 ms