Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA6BQ9H3T3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms