Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA6AQ9H2E6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms