Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms