Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAIP1Q9H074 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAIP1Q9H074 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms