Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM39BQ9GZU3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM39BQ9GZU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM39BQ9GZU3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms