Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIF3L1Q9GZT8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIF3L1Q9GZT8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms