Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms