Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A8Q9C0K1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms