Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE41Q9C0J9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE41Q9C0J9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms