Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP44Q9C0F1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP44Q9C0F1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms