Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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FOXQ1Q9C009 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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FOXQ1Q9C009 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXQ1Q9C009 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
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