Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFIH1Q9BYX4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms