Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
YTHDF1Q9BYJ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms