Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A8Q9BY19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms