Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUSAP1Q9BXS6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUSAP1Q9BXS6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms