Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D1Q9BX74 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM2D1Q9BX74 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms