Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP1Q9BWH6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP1Q9BWH6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP1Q9BWH6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP1Q9BWH6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP1Q9BWH6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP1Q9BWH6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP1Q9BWH6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP1Q9BWH6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP1Q9BWH6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms