Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXD3Q9BW11 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MXD3Q9BW11 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXD3Q9BW11 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms