Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM2Q9BV94 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms