Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDC1Q9BTX1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms