Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms