Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOK1Q9BRS2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIOK1Q9BRS2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms