Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY3

FAM118B, Protein FAM118B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM118BQ9BPY3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM118BQ9BPY3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM118BQ9BPY3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM118BQ9BPY3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms