Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYCBPQ99417 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYCBPQ99417 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms