Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNKPQ96T60 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNKPQ96T60 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms