Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE1Q96RT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE1Q96RT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms