Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms