Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPG4P5Q96PW8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms