Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN4Q96NY8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN4Q96NY8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN4Q96NY8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN4Q96NY8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NECTIN4Q96NY8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN4Q96NY8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms