Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD11Q96NU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms