Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSNARE1Q96NA8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1Q96NA8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms