Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RMDN2Q96LZ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN2Q96LZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN2Q96LZ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms