Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf72Q96LT7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf72Q96LT7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms