Protein–RNA interactions for Protein: Q96LJ8

UBXN10, UBX domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN10Q96LJ8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN10Q96LJ8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN10Q96LJ8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN10Q96LJ8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms