Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT74Q96LB3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms