Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALPK3Q96L96 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALPK3Q96L96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK3Q96L96 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms