Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHACTR3Q96KR7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHACTR3Q96KR7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHACTR3Q96KR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHACTR3Q96KR7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHACTR3Q96KR7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHACTR3Q96KR7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PHACTR3Q96KR7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PHACTR3Q96KR7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHACTR3Q96KR7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms