Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GJD4Q96KN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJD4Q96KN9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms