Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms