Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC136Q96JN2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC136Q96JN2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms