Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUCLG2Q96I99 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms