Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BCANQ96GW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BCANQ96GW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms