Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms