Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC51Q96ER9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC51Q96ER9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms